İdo ya da tam adıyla İstanbul Deniz Otobüsleri, İstanbul’un trafik sorununun ve deniz ulaşımı probleminin çözümüne bir katkıda bulunmak için İstanbul Büyükşehir Belediye Başkanlığı tarafından 1987 yılında kurulmuştur. Etrafı tamamen denizlerle çevrelenmiş İstanbul’da deniz yolu ile yapılan yolculuklar önemli bir ulaşım alternatifi görevi görmektedir. Trafiğin gün geçtikçe biraz daha karmaşaya dönüştüğü İstanbul’da uzun bir geçmişe sahip olan deniz otobüslerinden her geçen dakika çok daha verimli bir şekilde yararlanılmaktadır. 2005 yılının Mart ayında, TDİ’ye bağlı Şehir hatları İstanbul Deniz Otobüsleri’ne devredilmiştir. İstanbul Deniz Otobüsleri günümüz itibariyle 88 iskelesi ve 103 gemisiyle dünyanın en büyük yolcu ve araç deniz taşımacılığı şirketidir.
İstanbul’da her geçen gün artan trafik sorununa bir alternatif arayan İstanbul Büyükşehir Belediyesi 1987 ve 1988 yıllarında Norveç’ten satın aldığı 449 yolcu kapasiteli olan 10 adet deniz otobüsü ile yeni bir hizmet başlatmıştır. İdo bugün toplam 22 deniz otobüsü ile hizmet vermektedir. İstanbul Deniz Otobüsü 1995 yılında Avustralya’dan satın alınan 2 adet 155 yolcu kapasiteli deniz otobüsü ile 10 olan gemi sayısını 12’ye çıkarmıştır. 10 gemilik bir projenin ilk 2 tanesi olan ve 1996 yılında teslim alınan Avustralya yapımı 450 yolcu kapasiteli deniz otobüsleri ile bu sayı 14’ü bulmuştur. 1997 Norveç yapımı 400 kişilik 2 gemi ile 350 kişilik 3 gemi ve yine ilk defa Türkiye Gemi Sanayi Pendik Tersanesi’nde üretilmekte olan 400 kişilik bir adet geminin daha kullanılması ile gemi sayısı 20’ye yükselmiştir. Yalova – Yenikapı arasında çalıştırılmak üzere 94 araç, 500 yolcu kapasiteli arabalı feribot Avustralya’da 1997 yılında inşa ettirilmiştir. Yenikapı – Bandırma arasında karşılıklı bir şekilde çalıştırmak üzere yine aynı tersanedeki bir firmadan 800 yolcu kapasiteli 200 araçlık arabalı 2 feribot 1998 yılında inşa ettirilmiştir. Bu iki feribot 36 deniz mili gibi yüksek bir hıza ulaşabiliyor. 12 Aralık 2005 tarihinde yine aynı firma ile kontratı imzalanan ve 2007’de teslim edilen 2 adet yeni feribot ile yine Bursa-Yenikapı arasında ulaşım büyük oranda kolaylaşmıştır. Her biri 225 araç ve 1200 yolcu kapasiteli bu gemiler 35 deniz mili hıza sahip olup, mesafeyi 75 dakika gibi bir süreye indirmiştir. Ayrıca yine 2007 yılında 5 adet 30 deniz mili hız, 449 yolcu kapasiteli yeni deniz otobüsü alınmıştır.2004 yılının Nisan ayında 2 adet deniz otobüsü İdo’dan Kocaeli Büyükşehir Belediyesi’ne devredilmiştir.
İdo, 2005 yılının Şubat ayında ise İstanbul Büyükşehir Belediye Başkanlığı Özelleştirme Yüksek Kurulu yani ÖYK ile bir anlaşma yaparak Türkiye Şehir Hatları İşletmesini devralma isteği belirtmiş ve ortaya koymuştur. Devralma işlemleri ise İstanbul Büyükşehir Belediye Başkanlığı adına İdo tarafından yürütülmüştür. Devralma işleminin ardından İstanbul’da deniz ulaşımından sorumlu tek otorite sahibi İstanbul Büyükşehir Belediye Başkanlığı olmuştur. Bu otorite de çok büyük ölçüde İdo’ya devredilmiştir. İdo filosu günümüzde; Toplam 33 hat boyunca, 10 Hızlı Feribot, 35 Şehir hatları Yolcu Vapuru, 18 Araba Vapuru, 25 Deniz Otobüsü, 10 Deniz Taksi ve Mavi Marmara Yolcu Gemisi ile tam 88 noktaya hizmet sağlamaktadır. İstanbul-Bursa seferlerinde 2013’te hizmete açılan Bursa Deniz Otobüsleri yani BUDO şirketi yolculara bir seçenek daha sunmaktadır. İstanbul Büyükşehir Belediyesi’nin ortaklaşması ile İstanbul Deniz Otobüsleri Sanayi ve Ticaret Anonim Şirketi’nin yani İdo’nun yüzde 100 oranındaki hissesinin özelleştirilmesi ihalesinin son pazarlık sonucu bu ihaleyi, 861 milyon dolarlık büyük bir teklifle Tepe-Akfen-Souter-Sera isimli Ortak Girişim Grubu kazanmıştır.